Jest rok 2056 – nie tak odległa przyszłość – epidemia niewydolności narządów niszczy świat. Znajduje się jednak wybawiciel: GeneCo, firma biotechnologiczna oferująca przeszczepy organów, za odpowiednią ceną. Ci, którzy spóźniają się z opłatami zostają zapisani na listę do zwrotu i są ścigani przez okropnego Repo Mena (Anthony Head). W świecie ludzi uzależnionych od operacji plastycznych i środków przeciwbólowych, w świecie, w którym morderstwo jest dopuszczane przez prawo, chroniona przez ojca dziewczyna (Alexa Vega) szuka lekarstwa na swą własną, rzadką chorobę oraz informację na temat tajemniczej historii jej rodziny. Po tym jak zostaje wciągnięta w świat GeneCo, nie jest w stanie się z niego wyzwolić, a odpowiedzi na wszystkie swoje pytania odnajdzie podczas oczekiwanego przez wszystkich, spektakularnego wydarzenia: The Genetic Opera.